Acta Scientiarum Polonorum

Czasopismo naukowe założone w 2001 roku przez polskie uczelnie rolnicze

| Informacje | Recenzenci | Rada Programowa | Rady naukowe | Adresy redakcji | Serie | Wymogi edytorskie | Wzorcowy artykuł | Warunki publikacji | Procedura recenzowania | Prenumerata | Streszczenia | Szukaj | Statystyki |
Hortorum Cultus
(Ogrodnictwo) 14 (1) 2015
Tytuł
Genetyczna różnorodność Pyricularia grisea, czynnika wywołującego zarazę ryżową przez SRR
Autor
Mohammad Reza Safari Motlagh, Fatemeh Hbibi, Ali Akbar Ebadi
Słowa kluczowe
zaraza, zróżnicowanie genetyczne, Pyricularia grisea, PCR, ryż, SSR
Streszczenie
Pyricularia grisea, grzyb zarazy ryżowej, jest zagrożeniem dla plonów ryżu w Iranie i na całym świecie. W niniejszym badaniu przy użyciu 14 markerów mikrosateklitarnych oceniano różnorodność genetyczną P. grisea zebranego z różnych pól prowincji Guilan. Markery te tworzyły 64 polimorficznych wiązań przy średnio 4,57 wiązaniach dla każdego markera. Średnia informacji polimorficznych we wszystkich markerach wynosiła 0,734, średnia efektywna liczba alleli – 2,68, średnia heterozygotyczność oczekiwana Nei – 0,734 a średni indeks informacji Shannon – 1,05. Marker SSR43,44 miał największą zawartość informacji polimorficznej (PIC = 0.85), największą liczbę alleli obserwowanych (na = 8), liczbę efektywnych alleli (ne = 3.76), największą heterozygotyczność oczekiwaną Nei (Ne = 0,861) i indeks informacji Shannon (I = 1.38). Był to najlepszy spośród 14 markerów użytych do oceny różnorodności genetycznej P. grisea. Analizę skupień przeprowadzono za pomocą prostego współczynnika simple maching oraz metody UPGMA. Na podstawie wyników badań izolaty zaklasyfikowano do 3 linii przez odcięcie dendogramu na podobnym poziomie powiązań 0,76. Numer 1 był główną grupą i reprezentował większość tych izolatów. Wyniki analizy głównych współrzędnych także dzieliły izolaty na trzy grupy podobne do tych, które otrzymano za pomocą analizy skupień. Podsumowując, wyniki badań potwierdziły, że markert mikrosatelitarne to dobre i odpowiednie markery do analizy struktury P. grisea.
Strony
15-28
Cytowanie
Motlagh, M., Hbibi, F., Ebadi, A. (2015). Genetyczna różnorodność Pyricularia grisea, czynnika wywołującego zarazę ryżową przez SRR. Acta Sci. Pol. Hortorum Cultus, 14(1), 15-28.
Pełny tekst