Bakteria Xanthomonas campestris pathovar campestris (Xcc) jako przyczyna czarnej zgnilizny roślin z rodziny krzyżowych powoduje znaczne straty w plonie rolniczym na całym świecie. Zwalczanie czarnej zgnilizny, a także określenie Xcc na podstawie parametrów morfologicznych lub za pomocą testów patogeniczności jest trudne. W celu zoptymalizowania protokołu PCR przetestowano dziesięć różnych możliwości ekstrakcji DNA, a następnie metodę PCR. Na podstawie walidowanej metody ISTA zastosowano trzy zestawy primerów, mianowicie UBP 1052F-BACR, DLH 120-125 i ZUP 2309-2310. Porównano wyniki zmierzonego stężenia i jakości DNA oraz skuteczności dla amplifikacji PCR. Zalecono trzy sposoby ekstrakcji DNA w ramach protokołu detekcji Xanthomonas campestris pv. Campestris: zestaw komercyjny używany do izolacji z tkanek według Macherey-Nagel, MO BIO oraz zestaw dla hodowli mikrobowych według MO BIO.

141-150